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及时浇水。色素辣椒育苗管理中，注意每天早晨浇1次水，苗床不能缺水，浇水要浇透，尽量避开中午浇水。
补肥。色素辣椒苗在并完盘缓苗后开始补肥，并盘前不能补肥。补肥时先浇透苗床水，过半小时后在蓄水池内按每方水加入磷酸二氢钾+杀菌剂行补肥防病。
叶面施肥施药。并完盘后3-5天，每5-7天于上午12点前喷施1次1500倍氨基酸叶面肥+植物电子肥利用植物本身光合作用迸发出的高能电子与植物电子极性感应原理，提高细胞分裂、分子合成和营养匹配消化水平，加速新陈代谢频率，激活植物营养疏导系统产生超越肥效。
通风透气。为促进幼苗正常生长，辣椒育苗棚需正常揭盖棉被，白天温度控制在28-32℃，夜间控制在15-18℃。确保辣椒透风透光。