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香瓜通过嫁接可有效防止枯萎病、根腐病等土传病害的发生，解决设施栽培的连作障碍问题，不同砧木还可增强接穗植株的耐低温性、耐高温性、耐盐碱性等耐逆性，以及提高香瓜抗黄化褪绿病毒病等病害的能力。
目前香瓜嫁接普遍存在砧木亲和力较差、嫁接成活率较低等问题，对香瓜品质影响不一，不同香瓜品质必须选择对应的不影响品质及产量的专用砧木品种。专家建议用高抗香瓜枯萎病，病毒病抗性强，耐逆性强，不易早衰，不影响品质嫁接。嫁接后及时使用新高脂膜，可防氧化，防病菌侵入，制造真空环境抑制津液干枯，提高成活率。