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磷是植物体内多种重要化合物如核酸 核甘酸 磷脂等的组成成分。同时参与体内碳水化合物的合成，并参与碳水化合物分解成单糖，提供马铃薯生长的能量，以及脂肪的代谢等。磷肥促进根系发育，增强植株的抗旱 抗寒能力和适应能力。磷肥充足时，能提高氮肥的利用律，幼苗发育健壮，有利于植株体内各种物质的转化和代谢，促进植株早熟，增加块茎干物质和淀粉的积累，提高块茎品质、增强耐贮藏性。
缺磷常发生在各种土壤中，特别是酸性、粘重土壤，有效态磷易被固定而不能为作物吸收土壤中磷的利用律很低，马铃薯一般只能吸收10%，土壤中约90%的磷不能为马铃薯吸收利用，在沙性土壤中，保肥能力差，更易于发生缺肥。
磷肥不足，生育初期症状不明显，根系的数量和长度减少，植株生长缓慢，茎杆矮小或细弱僵立，缺乏弹性，分枝减少，叶柄上竖，叶片变小，向上卷屈，叶色暗绿无光泽，光合效率低。严重缺磷植株基部叶片叶尖褪绿变褐，逐渐向全叶扩展，叶片黄化，最后整个叶片枯萎脱落，并由下向上扩展到植株顶部，块茎开始形成 膨大和淀粉的积累都需要磷的参与，缺少会减少匍匐茎数量 使块茎少而小。有时块茎薯肉会出现褐色锈斑，蒸煮时锈斑处薯肉变硬，影响产量和品质。
为提高马铃薯的产量，应重视磷肥试用。在马铃薯播种时，应该以氮磷钾速效性复合颗粒肥作种肥施入播种沟内，尤其是在酸性土壤 粘重土和沙性种植马铃薯时，应特别注意试用磷肥。生育期间如发现缺磷，应及时进行叶面喷施0。1%~0。2%的磷酸二氢钾，傍晚喷施易于植株吸收，一般喷施2~3次。
土壤中磷素过多时，会减少马铃薯对锌和铁的吸收利用。